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关于染色质免疫共沉淀的原理介绍

发布时间:2021-12-17   点击次数:52次
  染色质免疫共沉淀技术的原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
  这项技术通过蛋白质与DNA互作来分析目标基因活性以及已知蛋白质的靶基因,被广泛应用于体内转录调控因子与靶基因启动子上特异核苷酸序列结合方面的研究。该技术常与DNA芯片和分子克隆技术相结合。
  染色体免疫共沉淀是基于体内分析发展起来的方法,也称结合位点分析法,在过去十年已经成为表观遗传信息研究的主要方法。这项技术帮助研究者判断在细胞核中基因组的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰。ChIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的关系。近年来,这种技术得到不断的发展和完善。采用结合微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌症、心血管疾病以及中枢神经系统紊乱等疾病的主要通路的一种非常有效的工具。
  染色质免疫共沉淀的原理介绍:
  一、检测目标基因活性
  在保持组蛋白和DNA联合的同时,染色质被切成很小的片断,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,将目标片段(组蛋白发生特异标记的片段)沉淀下来。ChIP是利用抗原和抗体的特异性结合以及细菌蛋白质的“proteinA”特异性地结合到免疫球蛋白的Fc片段的现象合用开发出来的方法(免疫磁珠结合proteinA,proteinA结合抗体Fc段,抗体结合抗原即发生特异标记的组蛋白,这里要注意组蛋白是和DNA结合的,这样就把目标组蛋白和DNA的复合体沉淀下来了)。再将组蛋白与DNA分离,用获得的DNA去做PCR分析和序列测定等检测技术,从而进一步检测哪些基因的组蛋白发生了修饰。
  二、检测已知蛋白的靶基因
  在生理状态下把细胞内的蛋白质和DNA交联在一起,超声波将其打碎为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过所要研究的目的蛋白质特异性抗体沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA段,通过对目的片断的纯化与检测,从而明确蛋白与哪些基因相互作用。

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