产品中心您的位置:网站首页 > 产品中心 > 蛋白和DNA相互作用 > CUT&Tag > CUT-Tag技术服务-研究DNA与蛋白互作

CUT-Tag技术服务-研究DNA与蛋白互作

更新时间:2022-05-20

访问量:49

厂商性质:生产厂家

生产地址:

简要描述:
CUT-Tag互作技术服务是研究DNA与蛋白互作的新技术。与ChIP-Seq相比,CUT-Tag不需要甲醛交联和免疫共沉淀的过程,而是通过靶蛋白的抗体和Protein A的介导,使Protein A融合的Tn5转座酶靶向并切割DNA,同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成高通量测序文库。
品牌其他品牌

CUT-Tag互作技术服务-研究DNA与蛋白互作(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是研究DNA与蛋白互作的新技术。与ChIP-Seq相比,CUT&Tag不需要甲醛交联和免疫共沉淀的过程,而是通过靶蛋白的抗体和Protein A的介导,使Protein A融合的Tn5转座酶靶向并切割DNA,同时在序列两端加上测序接头,经PCR扩增后形成高通量测序文库。

CUT-Tag互作技术服务-研究DNA与蛋白互作实验流程图

CUT&Tag流程图.png

细胞与ConA beads结合——细胞渗透性处理——一抗与目的蛋白特异性结合——二抗结合一抗放大信号——加入pA-Tn5与抗体结合——通过Mg2+激活转座体,片段化目的蛋白结合的DNA,并加上接头序列——DNA提取与扩增-高通量测序

 

客户提供材料 实验过程图

冻存细胞:细胞数>10万

冻存组织:组织量>40 mg

一抗(请使用ChIP级别的一抗,提供未稀释的抗体原液,

送样前请将抗体的说明书发给我们,以便安排后续实验

高通量测序原始数据

生物信息学分析结果

 

使用CUT&Tag,鉴定H3K27me3在染色质水平上的peaks。与ChIP-seq相比,在相同Reads条件下,两者的Peaks一致,并且CUT&Tag的信噪比更高、背景更低。


参考文献:

Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG, Ahmad K, Henikoff S. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930. doi: 10.1038/s41467-019-09982-5.

 

CUT&Tag,DAP-seq,ChIP-seq技术对比
技术名称 CUT&Tag DAP-seq ChIP-seq
实验模式 体内 体外 体内
是否需要特异性抗体
样本适用性 对细胞活性要求高,不兼容冷冻样本,能够对极少量样品进行分析 所有物种,各种组织器官,新鲜组织、冻存组织皆可 所有物种,各种组织器官,新鲜组织、冻存组织皆可
信噪比 背景噪音低,所需测序深度少 噪音高,所需测序量相对较多 噪音高,所需测序量相对较多

 

 

 

 

留言框

  • 产品:

  • 您的单位:

  • 您的姓名:

  • 联系电话:

  • 常用邮箱:

  • 省份:

  • 详细地址:

  • 补充说明:

  • 验证码:

    请输入计算结果(填写阿拉伯数字),如:三加四=7

联系我们

contact us

咨询电话

15632249798

扫一扫,关注我们

返回顶部