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DAP-SEQ体外蛋白表达载体构建protocol

发布时间:2021-04-09   点击次数:833次

在表观遗传学研究中,寻找转录因子的调控位点是困扰科学家的难题,经典的ChIP-seq技术存在很多弊端,最主要的是抗体问题,对于非模式植物更难入手。与ChIP-seq相比,DAP-seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,所以DAP-seq具有快速、高通量、节约时间成本等显著优势。

DAP-seq是研究非模式植物顺反组和表观组的有力技术,大大扩展和加深了科学家们研究的转录因子结合位点信息。它能够捕获全部转录结合位点,因此能获得完整的密码本。并且,DAP-seq无需复杂和专门的实验设备,这种方法可用于所有模式或非模式植物。这为我们提供了一扇窗口,来发现调控序列中表观遗传变异影响植物性状的机制。

DAP-seq实验流程:

构建体外蛋白表达载体→体外蛋白表达→DNA文库构建→亲和纯化→上机测序

 

下图是DAP-seq体外蛋白表达载体构建的protocol

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