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简单介绍小麦全外显子捕获技术的作用

更新时间:2023-04-19   点击次数:967次
  小麦全外显子捕获是一种基于高通量测序的技术,可以快速检测小麦基因组中的所有外显子区域。它可以用于对小麦基因组的进一步研究,包括遗传多样性分析、功能基因组学、耐旱、耐盐等重要农业特性的研究。此外,小麦全外显子捕获也可以用于诊断小麦中的基因突变,以便培育更高产、更健康和更适应不良环境的小麦品种。
  小麦全外显子捕获技术优点多多。首先,它能够高效地鉴定小麦基因组中的各种遗传变异,包括单核苷酸多态性(SNP)、插入和缺失变异以及基因重排等。其次,它能够快速地获得大规模的基因组数据,为小麦基因组的功能研究提供重要的数据支持。最后,小麦全外显子捕获技术还可用于小麦品种鉴定,保护小麦种质资源,为小麦育种和生产提供重要的辅助技术。
  相比于其他基因测序技术,小麦全外显子捕获技术也存在一些限制。首先,该技术需要依赖高质量的全基因组参考序列,否则会影响数据的准确性和可靠性。其次,小麦基因组非常复杂,存在着丰富的多态性和复杂的基因重排,因此,在进行数据分析和解读时,需要利用多种分析工具和数据库进行验证和比对,以保证数据分析的可靠性和精度。
  myBaits Expert Wheat Exome与国际小麦基因组测序联盟(IWGSC)合作开发,使用了IWGSC发布的中国春基因组和注释信息。靶向六倍体小麦中完整的高置信度且有基因注释的外显子区域,能够全面、统一、可靠地深入覆盖大干15 Gb的小麦基因组中超过250 Mb的CDS及其邻近区域。该panel包含两百多万条探针,运用优化算法设计,并经过实验进一步优化,兼容市面上已知的文库制备方法及测序平台。与全基因组测序相比,该panel大大降低了外显子组研究的测序和分析成本。