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siPOOL文库,使您获得值得信赖的RNAi筛选结果

更新时间:2023-08-07   点击次数:424次

siPOOL文库:改进和节省您的RNAi筛选实验

siPOOL文库中的每个基因均被混池化的30条siRNA靶向

为什么要做RNA干扰(RNAi)?

RNA干扰(RNAi)是一种广泛用于研究基因功能的基因沉默工具。这是由于它拥有多种优势:易于使用、适用于各种细胞类型、类似药物的特性、可快速获得结果等。然而,合成的短干扰RNA(siRNAs)通常会存在脱靶效应,这将导致实验结果的不稳定,因此后续还需要开展更多的验证工作,既费时又费力。 如果采用高复杂度的siRNAs池(简称siPOOLs),可以大大降低脱靶效应,进一步提高RNAi方法在基因功能研究中的可靠性和效率。


siPOOLs如何提高特异性?

siPOOLs是由优化设计合成的30条siRNA组成的复杂混池。采用高复杂度的混池方法,使每条siRNA的浓度均相应降低,致使特异性siRNA的脱靶效应得以稀释。相反地,siPOOLs具有较高的转录组覆盖率,可以进一步提高基因敲除的效率。由此产生的功能表型结果也更加的可靠,重复性也更好。


左:在相对较高的浓度下使用单个siRNA或低复杂度siRNA池,以实现有效的敲除。然而,高浓度可能会导致普遍的脱靶效应,从而产出易变的结果。右:siPOOLs是由30条特定的siRNAs构成的复杂混池,具有不同的种子序列,能够较大限度地覆盖靶标基因。采用混池化方法将每条siRNA的浓度降低。较低的浓度可有效消除脱靶效应,并提高基因沉默结果的可靠性。


我们提供专业的技术支持

我们的团队是由具备多年RNAi筛选经验的专家组成,在siRNA设计和RNAi筛选数据分析(包含siRNA和基于shRNA的筛选)方面有深入的专业研究,可以为您的RNAi检测开发和筛选研究提供科学、专业的技术支持。


与时俱进的siPOOL文库

为了确保siPOOLs针对当前注释的基因,设计团队会根据新版的RefSeq注释不断更新siPOOL的设计。

产品名称

物种

规格

产品编号

E3 Ligase siPOOL library

E3连接酶siPOOL库

human

1 nmol

si-L010-000E3L

human

0.5 nmol

si-L005-000E3L

human

0.25 nmol

si-L002-000E3L

human

0.1 nmol

si-L001-000E3L

Kinase siPOOL library

激酶siPOOL库

human

1 nmol

si-L010-000505

human

0.5 nmol

si-L005-000505

human

0.25 nmol

si-L002-000505

human

0.1 nmol

si-L001-000505

RNA-binding protein siPOOL library

RNA结合蛋白siPOOL库

human

1 nmol

si-L010-000RBP

human

0.5 nmol

si-L005-000RBP

human

0.25 nmol

si-L002-000RBP

human

0.1 nmol

si-L001-000RBP

GPCR siPOOL library

GPCR siPOOL库

human

1 nmol

si-L010-00GPCR

human

0.5 nmol

si-L005-00GPCR

human

0.25 nmol

si-L002-00GPCR

human

0.1 nmol

si-L001-00GPCR

Ubiquitinase siPOOL library

泛素化酶 siPOOL库

human

1 nmol

si-L010-000UBI

human

0.5 nmol

si-L005-000UBI

human

0.25 nmol

si-L002-000UBI

human

0.1 nmol

si-L001-000UBI

通常,siPOOLs产品采用携带条形码的离心管。也可根据客户需求定制96孔板或384孔板布局的siPOOLs产品。


运输和保存

siPOOL库,以悬液的形式保存,常温(RT)下运输。如有特别要求,siPOOL也可以干粉形式运输。siPOOL库可以稳定地在RT下运输至少4周。到达后,siPOOL库应存储在-20℃至-80℃。在这样的条件下,siPOOL库至少稳定保存两年。如果siPOOL库以干粉形式运输,siPOOL需采用无RNase的水进行重悬。

在客户收到(或重悬)siPOOLs产品后,我们建议您将siPOOLs分装成小体积,存储在-20℃到-80℃条件。为了达到最佳效果,尽量减少反复冻融的次数。在良好的储存条件以及规范的操作处理下,siPOOLs可稳定保存至少2年。


引用文献

Hannus M. et. al.: siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049-61(2014)

Marine S. et. al.: Common Seed Analysis to Identify Off-Target Effects in siRNA Screens. Journal of Biomolecular Screening 1-9 (2011)

Jackson A. et. al.: Expression Profiling reveals off-target gene regulation by RNAi. Nature Biotechnology (2003)