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微生物鉴定与微生物多样性测序

更新时间:2024-03-19

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简要描述:
16S rRNA测序服务(微生物多样性研究)
16S rRNA测序是一种扩增子测序,主要用于研究环境样品中细菌群落结构组成、挖掘样品之间的差异。
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16S rRNA测序服务(微生物多样性研究)

 

16S rRNA测序是一种扩增子测序,主要用于研究环境样品中细菌群落结构组成、挖掘样品之间的差异。相比于传统的分离培养方法,扩增子测序的优点包括:无需分离培养、准确、快速、灵敏等。

 

技术原理

16S rRNA 位于原核细胞核糖体小亚基上,包括 10个保守区和9个可变区,保守区在细菌间差异不大,可变区具有属或种的特异性,随亲缘关系不同而存在差异。16S rDNA 非常适用于细菌系统发育和分类鉴定的指标。16S rDNA 扩增子测序,通常是选择1-2个可变区,利用保守区设计通用引物进行 PCR 扩增,再对可变区进行测序分析和菌种鉴定。16S rDNA 扩增子测序技术是研究环境样品中微生物群落结构组成、挖掘样品之间差异的重要手段。同理,18S rRNA 和ITS测序分别是针对真核微生物和真菌多样性研究的分类鉴定手段。

 

样本类型

土壤、水体、污泥、肠道物、粪便、皮肤、食品发酵液等。

 

技术路线

  • 样品准备

  • DNA提取与质检

  • PCR扩增

  • 产物纯化

  • 文库制备及库检

  • 上机测序

  • 生信分析

 

技术优点

  • 成本低

  • 周期短

  • 数据准确

  • 结果灵敏


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