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宏基因组测序服务(微生物多样性研究)

更新时间:2024-03-19

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简要描述:
宏基因组测序服务(微生物多样性研究)
宏基因组测序,能够快速准确的得到大量生物数据和丰富的微生物信息,是研究微生物多样性和群落特征的重要手段。

 

 

宏基因组测序服务(微生物多样性研究)

 

微生物群体几乎存在于世界的每一个生态群落之中,且扮演着重要的的角色。传统的微生物培养及鉴定方法,极大地限制了微生物多样性资源的研究及开发利用。宏基因组测序,能够快速准确的得到大量生物数据和丰富的微生物信息,是研究微生物多样性和群落特征的重要手段。

 

技术原理

2005 年,加州大学伯克利分校的 Kevin Chen 和Lior Pachter 将宏基因组定文为“应用现代基因组学的技木直接研究自然状态下的微生物的有机群落,而不需要在实验室中分离单一的菌株”的科学。宏基因组测序是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,提取环境样本总 DNA,获得环境微生物基因信息总和,研究环境微生物的群落结构、物种分类、基因功能及代谢网络等,具有通量高、速度快、信息全等特点,在鉴定低丰度的微生物群落、挖掘更多基因资源方面具有很大优势。

 

样本类型

土壤、水体、污泥、肠道物、粪便、皮肤、食品发酵液等。

 

技术路线

  • 样品准备

  • DNA提取

  • DNA检测

  • 文库制备

  • 文库质检

  • 上机测序

  • 生信分析

 

技术优点

  • 应用广

  • 通量高

  • 速度快

  • 数据全(不仅可以鉴定微生物群落,还可以挖掘功能基因及其代谢途径)


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