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一文带你了解什么是转录因子结合位点

发布时间:2021-10-27   点击次数:54次
  转录因子结合位点(Transcriptionfactorbindingsite,TFBS)是与转录因子结合的DNA片段,长度通常在5~20bp范围内,一个转录因子往往同时调控若干个基因,而它在不同基因上的结合位点具有一定的保守性,又不完全相同
  对经过生物实验验证的已知位点进行分析可知,转录因子结合位点往往以保守短序列片段(亦称作motif)的形式出现.对于原核基因组,模体的长度一般为10~30bp,而对于真核基因组,其长度更短,通常为5~15bp.与其它常见的序列模体信号相比,转录因子结合位点模体除了n长度较短以外,其碱基组成也更加灵活,容许较多的错配.
  数百种转录因子在不同个体细胞类型中按照不同组合类型表达,伴随胚胎发育进行,还在不断变化,这让生物学家很难准确地理解转录因子如何控制胚胎发育。而且许多研究结果甚至自相矛盾。例如,生化实验表明一个家族中与相同DNA序列相结合的TFs,在遗传学实验中却被证明它们在发育胚胎细胞中的活性非常不同。
  “因此,我们才应该确定某个特定TF的结合位点和它将要激活的靶基因,”Small解释道。
  以博后学者RheaDatta为首的科学家们研究了果蝇的两个相似的TFs(Bicoid[Bcd]和Orthodenticle[Otd]),过去的研究显示,它们与一段相同的DNA序列(TAATCC)结合。
  研究人员直接绘制了Bcd和Otd在胚胎中的整个遗传区域结合图谱,结果显示一些区域可以结合两种蛋白,另一些区域只能结合二者之一。进一步研究发现,实际上两种蛋白的结合偏好与它们的共用TAATCC序列相比仅有一个碱基之差,此外,Bcd的结合仅发生在包含另外两种TFs结合位点的基因组区域,这两种TFs可能有助于Bcd的结合。
  至此,一个TFs与之结合、控制基因表达、决定细胞命运的精确DNA序列终于水落石出。

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