ChIP-Seq对样品有哪些要求？

　　染色质免疫共沉淀测序（ChIP-Seq）是指对染色质免疫共沉淀（ChIP）获得的DNA的片段进行大规模测序，并能把所研究蛋白的DNA结合位点精确定位到基因组上。

　　RocheGSFLXTitanium、IlluminaHiseq2000和ABSOLID4这3种测序技术均可以用于ChIP-seq，其中采用IlluminaHiseq2000进行ChIP-Seq已有较多文献报道。

　　ChIP-Seq技术高质量、高通量、低成本的数据产出，为表观遗传组学研究奠定了技术基础。研究者可以在以下几方面展开研究：

　　（1）判断DNA链的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰；

　　（2）检测RNApolymeraseII及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位；

　　（3）研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系；

　　（4）CTCF转录因子研究。

　　ChIP-Seq有什么样品要求？

　　（1）请提供浓度≥10ng/ul、总量≥20ng、OD260/280为1.8~2.2的DNA样品；若单次ChIP后DNA量不够，建议将2~3次ChIP的DNA合并在一起。

　　（2）请提供DNA打断时检测胶图，要求打断后DNA电泳主带在100-500bp范围内；请对于ChIP获得DNA设计引物进行QPCR验证和定量，能够提供检测位点的检测报告。附阳性和阴性对照。

　　（3）样品请置于1.5ml管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50ml带盖离心管中，再将50ml管放在封口袋中。为了防止低浓度样品黏附在离心管壁上，请使用non-sticktube运输DNA；建议使用冰袋运输，并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。