产品中心您的位置:网站首页 > 产品中心 > 蛋白和DNA相互作用 > DAP-seq > 转录因子结合位点方法

转录因子结合位点方法

更新时间:2021-10-12

访问量:64

厂商性质:生产厂家

生产地址:

简要描述:
转录因子结合位点方法
DAP-Seq将蛋白质体外表达技术与高通量测序技术相结合,不需要针对每个转录因子制备特异性抗体,所以DAP-Seq具有快速、高通量、节约时间成本等显著优势,比ChIP-seq更易于扩展。
品牌其他品牌

转录因子结合位点方法

高通量检测转录因子或DNA结合蛋白

在基因组上的结合位点

在功能基因组学和表观遗传学研究中,转录因子结合位点(TFBS)的发掘一直是研究热点。传统的ChlP-seq(染色质免疫共沉淀测序)方法,在抗体质量很好的情况下能够有效检测到TFBS。

然而,好的抗体可遇不可求,

这限制了ChlP-seq更广泛的应用。

DAP-seq技术的出现,

使TFBS的研究不再局限于物种,

不再受抗体质量的限制,

为生命科学和医学领域转录因子的研究提供了新的有效工具。

生信分析

1

对原始数据进行去除接头、污染序列及低

Peak序列模式发掘(motif search)

质量reads的处理

已知motif注释

数据产出统计

Peak相关基因鉴定

3参考序列比对分析

1Peak相关基因的GO和KEGG富集分析

测序reads富集区域扫描(peak calling)

Peak长度分布统计

1

测序数据的差异分析(>=2个样本)

Peak在基因功能元件上的分布统计

1测序数据的可视化分析

项目可行性分析

本地保存成功

x

开展项目之前,我们会根据您具体的转录因子做可行性分析报告,供您参考,从多个方面进行可行性分析,包括转录因子分子量,亚细胞定位预测,跨膜区预测,蛋白质结构域预测、翻译后修饰预测,并且根据文献报道和我们的经验来进行可行性分析。

转录因子结合位点方法

相关服务:

1、 凝胶阻滞实验(EMSA):DAP-seq后续验证服务。

2、 酵母单杂交:DAP-seq后续验证服务

3、 ChIP-seq:高效检测重组蛋白、转录因子在基因组的结合位点

4、 DAP-seq与RNA-seq联合分析: 分析转录因子的靶基因在RNA-seq数据中的表达变化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq测序数据,增加转录组测序的分析深度。

5、 DNA-pull down:鉴定与DNA结合的蛋白。

6、 精美的论文图片设计与制作:专业设计师,设计精美论文插图,提升论文的严谨性和美观度。

DAP-seq是基于DNA亲和纯化,通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术,具有不受抗体和物种限制,且高通量的优势,自该技术问世以来,已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。能帮助您快速找到转录因子的结合位点,寻找转录因子调控的靶基因。




留言框

  • 产品:

  • 您的单位:

  • 您的姓名:

  • 联系电话:

  • 常用邮箱:

  • 省份:

  • 详细地址:

  • 补充说明:

  • 验证码:

    请输入计算结果(填写阿拉伯数字),如:三加四=7

联系我们

contact us

咨询电话

15632249798

扫一扫,关注我们

返回顶部